Seringkali, melihat tumpukan data medis itu seperti mencoba memahami plot twist di film Christopher Nolan tanpa spoiler: membingungkan dan bikin pusing tujuh keliling. Namun, sekelompok peneliti baru-baru ini berhasil memecahkan kode rahasia dalam data klinis pasien COVID-19 yang mungkin lebih akurat daripada feeling jomblo terhadap drama Korea. Penelitian mutakhir ini mengungkap potensi luar biasa dari molekul kecil bernama miRNA sebagai penanda prediktif, bahkan lebih jitu dari tebakan siapa main character favorit di serial terbaru. Jadi, bersiaplah untuk menyelami bagaimana studi ini berhasil Mengungkap Kode Rahasia: miRNA, Penanda Prediktif COVID-19 yang Lebih Akurat dari Drama Korea.
Mengintip Portofolio Warga Multiverse dan Drama Klinisnya
Studi ini bagai gathering komunitas internasional, melibatkan 31 individu sehat sebagai kontrol dan 154 pasien terinfeksi. Menariknya, mereka semua datang dari 40 negara berbeda yang ada di Uni Emirat Arab (UEA), sebuah negara yang memang dikenal sebagai ‘melting pot’ berbagai bangsa. Peserta paling banyak berasal dari India, Filipina, dan Pakistan, membuktikan bahwa sains memang tidak mengenal batas geografi, sama seperti passion terhadap online game atau streaming service.
Dari segi demografi, proporsi laki-laki dan perempuan dalam penelitian ini cukup stabil, sekitar 74-75% laki-laki dan 25-26% perempuan, baik di kelompok kontrol maupun terinfeksi. Usia rata-rata kedua kelompok ini juga tidak jauh berbeda, berkisar antara 44 hingga 47 tahun. Ini menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 tidak diskriminatif dalam memilih target berdasarkan usia, mirip seperti notifikasi update aplikasi yang selalu muncul tanpa pandang bulu.
Satu hal yang cukup mencuri perhatian adalah rata-rata Indeks Massa Tubuh (BMI) peserta, yang berada di kisaran 27-28. Angka ini secara umum mengindikasikan bahwa kelompok studi ini mayoritas termasuk dalam kategori kelebihan berat badan. Tampaknya, tren work from home dan rutinitas rebahan dengan cemilan favorit memang sudah mendunia, bahkan sebelum pandemi secara resmi menyerbu.
Ketika menganalisis data klinis, para peneliti menemukan beberapa indikator vital pada pasien terinfeksi yang seolah sedang “eror 404”. Level ferritin, C-reaktif protein (CRP), dan alanine transaminase (ALT) melonjak signifikan, jauh melampaui rentang normal yang sudah ditetapkan. Ini menunjukkan adanya respons inflamasi dan gangguan organ yang cukup serius pada tubuh pasien COVID-19.
Selain itu, level sel darah putih (WBC), hemoglobin, dan urea juga sedikit meningkat pada pasien terinfeksi, meskipun masih dalam batas normal. Namun, terjadi penurunan yang cukup kentara pada glomerular filtration rate (GFR), sebuah indikator penting fungsi ginjal, meskipun juga masih dalam rentang normal. Penurunan lymphocyte yang sedikit pun ikut diamati, mengindikasikan bahwa sistem pertahanan tubuh sedang bekerja keras namun mungkin sedikit tertekan.
Membedah Kode Genetik Tersembunyi: Misi Pencarian miRNA
Setelah menelisik data klinis, para ilmuwan ini melakukan deep dive ke level molekuler, layaknya hackathon untuk mengungkap kode tersembunyi. Mereka mengekstraksi RNA dari sampel usap nasofaring dan menganalisisnya menggunakan miRNA sequencing (miRNAseq). Proses ini melibatkan 13 sampel kontrol dan 38 sampel dari pasien terinfeksi, memastikan jumlah data yang cukup untuk analisis statistik yang solid.
Dari total 1788 transkrip miRNA yang teridentifikasi, sekitar 1456 di antaranya adalah miRNA yang sudah dikenal, sementara 332 lainnya merupakan miRNA baru. Ini seperti menemukan kombinasi antara aplikasi lama yang sering kita pakai dan beberapa apps baru yang belum pernah muncul di App Store. Sungguh sebuah treasure hunt di dunia seluler!
Hebatnya, infeksi SARS-CoV-2 ternyata hanya mengubah sekitar 2,6% dari total miRNA yang ada di tubuh manusia. Ini menandakan bahwa virus tersebut memiliki kemampuan memilih target yang sangat spesifik, mirip seorang hacker yang hanya merusak beberapa folder krusial dalam sebuah sistem besar. Di antara miRNA yang berubah signifikan, 44 di antaranya sudah dikenal dan 4 lainnya adalah miRNA baru, dengan 29 mengalami peningkatan dan 15 mengalami penurunan ekspresi.
Beberapa miRNA menunjukkan perubahan ekspresi yang sangat dramatis. Misalnya, miR-146b-3p dan miR-365b-3p mengalami peningkatan yang signifikan, sementara miR-202-5p mengalami penurunan yang mencolok. Di antara miRNA baru, novel-miR-285-5p menunjukkan peningkatan yang berarti, sedangkan tiga lainnya (miR-115-5p, miR-189-5p, dan miR-264-3p) mengalami penurunan. Ini seperti melihat grafik saham yang tiba-tiba melesat atau anjlok drastis setelah pengumuman penting.
Ujian Seleksi Biomarker: ROC Curve Sang Penentu Akurasi
Untuk membuktikan apakah miRNA ini benar-benar bisa jadi “detektor handal” infeksi SARS-CoV-2, para peneliti menggunakan analisis kurva Receiver Operating Characteristic (ROC). Ini adalah semacam ujian kecerdasan untuk biomarker, mengukur seberapa akurat mereka bisa membedakan antara positif dan negatif, seperti tes kepribadian yang (katanya) bisa tahu Anda introvert atau ekstrovert.
Beberapa miRNA menunjukkan performa yang sangat mengesankan dalam diskriminasi ini. miR-146b-3p, misalnya, mencatat Area Under the Curve (AUC) sebesar 0.999, angka yang nyaris sempurna 1, seperti skor ujian yang mendekati 100! miRNA lain seperti miR-154-5p, miR-335-3p, dan miR-30c-5p juga tampil cemerlang dengan nilai AUC yang tinggi. Bahkan, di antara miRNA baru, N-miR-264-5p dan N-miR-115-5p menunjukkan potensi diagnostik yang kuat.
Menggabungkan beberapa miRNA dalam satu panel diagnosis ternyata meningkatkan akurasi secara signifikan. Layaknya Avengers yang bersatu, panel miRNA multi-anggota ini mampu mencapai nilai AUC antara 0.939 hingga 0.972. Ini menunjukkan bahwa teamwork miRNA jauh lebih efektif daripada mengandalkan satu “superhero” saja dalam mendeteksi COVID-19 dari sampel usap hidung.
Jaringan Pertemanan Data: Korelasi Antara Klinis dan miRNA
Dalam studi ini, para peneliti juga penasaran apakah data klinis dan ekspresi miRNA ini memiliki “jaringan pertemanan” yang erat. Mereka melakukan analisis korelasi, dan hasilnya menunjukkan bahwa memang ada hubungan timbal balik yang signifikan antara keduanya. Misalnya, level ferritin menunjukkan korelasi positif yang kuat dengan CRP, WBC, dan ALT, seolah mereka adalah geng yang selalu muncul bersamaan di setiap event inflamasi.
Yang lebih menarik, ada korelasi signifikan antara level ekspresi miRNA dengan penanda klinis. N-miR-115-5p, misalnya, menunjukkan korelasi negatif dengan konsentrasi ferritin, sementara N-miR-30c-5p berkorelasi positif dengan urea dan CRP. Ini seperti love-hate relationship di drama yang kompleks, di mana satu faktor memengaruhi yang lain secara tak terduga.
Penemuan ini menegaskan bahwa ada hubungan biologis yang jelas antara ekspresi miRNA spesifik dan penanda klinis. Ini berarti, miRNA tidak hanya sekadar penanda pasif, tetapi juga berinteraksi dengan proses biologis yang mendasari perubahan klinis pada pasien. Bayangkan miRNA sebagai remote control yang memengaruhi setting tubuh Anda secara langsung.
Jalur Rahasia dan Plot Twist Penyakit: Implikasi Jangka Panjang
Setelah mengidentifikasi miRNA yang berulah dan korelasinya, langkah selanjutnya adalah mengungkap “proyek” biologis apa saja yang terpengaruh. Para peneliti mencari target gen dari miRNA-miRNA tersebut yang sudah teruji secara eksperimental. Hasilnya, sepuluh miRNA utama terbukti menargetkan total 122 gen manusia. Ini bagaikan menemukan cetak biru lengkap dari sebuah mesin kompleks.
Analisis lebih lanjut mengungkapkan bahwa gen-gen target ini terlibat dalam berbagai jalur biologis krusial, termasuk jalur FoxO, MAPK, neurotrophin, PI3-AKT, prolactin, relaxin, TGF-β, AGE-RAGE, ErbB, dan apelin signaling. Ini adalah “jalan tol” utama dalam sistem tubuh yang mengatur pertumbuhan sel, respons imun, hingga metabolisme. Penemuan ini menunjukkan betapa kompleksnya dampak infeksi SARS-CoV-2 di tingkat molekuler.
Lebih jauh, analisis fungsi gen menunjukkan bahwa gen-gen target ini berperan dalam berbagai proses biologis seperti transkripsi, apoptosis (kematian sel terprogram), morfogenesis, fosforilasi protein, dan proliferasi sel. Bahkan, ekspresi gen-gen ini juga dikaitkan dengan berbagai penyakit, terutama beragam jenis kanker, osteoporosis, hypercholesterolemia, gagal ginjal, dan infeksi HPV. Ini adalah plot twist yang signifikan, menggarisbawahi bahwa disregulasi miRNA akibat SARS-CoV-2 bisa punya konsekuensi serius jangka panjang.
Singkatnya, penelitian ini ibarat menemukan “kode cheat” baru untuk mendeteksi dan memahami dampak COVID-19. Dengan kemampuan miRNA sebagai penanda prediktif yang sangat akurat dan korelasinya yang erat dengan data klinis serta jalur biologis penting, kita mungkin selangkah lebih dekat menuju diagnosis yang lebih cepat dan pemahaman yang lebih mendalam tentang long-term effects dari infeksi ini. Masa depan diagnosis penyakit sepertinya tidak akan lagi sekadar tebak-tebakan, melainkan berbasis data yang cerdas dan molekul kecil yang perkasa.
